5 सितंबर, 2017 को अपने घर पर पत्रकार गौरी लंकेश को गोली मारने के आरोपी परशुराम वाघमोर (26) के एक ठिकाने पर एक टूथब्रश से डीएनए मैच हुआ है जो मामले में दायर कर्नाटक एसआईटी आरोप पत्र में सबूतों के प्रमुख टुकड़ों में से एक है। वाघमोर का डीएनए प्रोफ़ाइल “समान है और डीएनए 376/2018 के आइटम नंबर 6 में भेजे गए टूथब्रश पर पाए गए कोशिकाओं के डीएनए प्रोफ़ाइल परिणाम के साथ मेल खाता है”, यह रिपोर्ट 16 नवंबर 2018 को कर्नाटक फॉरेंसिक साइंस के डीएनए अनुभाग से मिलती है। प्रयोगशाला, जो 18 लोगों के खिलाफ दायर 9,235 पृष्ठों की चार्जशीट का हिस्सा है।
श्री राम सेना के एक पूर्व कार्यकर्ता, वाघमोर, जिन्हें सनातन संस्था से जुड़े एक अति दक्षिणपंथी समूह द्वारा बंदूकों का उपयोग करने के लिए भर्ती किया गया और प्रशिक्षित किया गया था, की पहचान एसआईटी ने उस व्यक्ति के रूप में की है जिसने लंकेश को गोली मारी थी। वाघमोर के डीएनए वाला टूथब्रश एक संदिग्ध व्यक्ति की हत्या के बाद डंप की गई सामग्री के बीच था – एक इमारत के ठेकेदार एच एल सुरेश, जिनके घर का इस्तेमाल हत्या की योजना बनाने और उसे अंजाम देने के लिए किया जाता था।
हिंदू जनजागृति समिति (HJS) के एक कार्यकर्ता – सुरेश की गिरफ्तारी के बाद एसआईटी ने अगस्त 2018 में नकली वाहन नंबर प्लेट जैसे टूथब्रश, कपड़े और अन्य सामग्री से भरा एक बैग बरामद किया था- जिसे कथित रूप से डिस्पोजल सामग्री के साथ छिपाकर पीछे छोड़ दिया गया था। एसआईटी ने हत्या के कथित मास्टरमाइंड अमोल काले (39), जो एचजेएस के पूर्व पुणे संयोजक हैं, के डीएनए प्रोफ़ाइल के साथ ठिकाने पर कंबल पर मिले बालों से मिले डीएनए स्ट्रैंड्स का भी मिलान किया है।
SIT ने गुजरात डायरेक्टोरेट ऑफ़ फॉरेंसिक साइंसेज की एक रिपोर्ट को भी हत्या के वीडियो फुटेज की तुलना में अदालत में रखा है, जो उसके घर पर एक सीसीटीवी कैमरे में कैद हुई है, शूटिंग के एक मनोरंजन के साथ जो जून 2018 में वाघमोर की गिरफ्तारी के बाद आयोजित किया गया था। गैट एनालिसिस रिपोर्ट बताती है कि वाघमोर की प्रोफाइल और तौर-तरीके लंकेश को गोलियों से भूनते हुए दिखाई देते हैं।
मुख्य संदिग्धों द्वारा कथित तौर पर इस्तेमाल किए जाने वाले मोबाइल फोन के कॉल डेटा रिपोर्ट (सीडीआर) का विश्लेषण भी एसआईटी ने आरोप पत्र में प्रस्तुत किए गए परिस्थितिजन्य सबूतों में से है। एसआईटी ने पाया है कि मुख्य संदिग्धों ने ऐसा प्रतीत करने का प्रयास किया कि वे हत्या के समय बेंगलुरु में नहीं थे, लेकिन अपने गृहनगर में या तो अपने फोन को घर पर छोड़ दिया था या उन्हें बंद कर दीया गया था।
वाघमोर को लंकेश के घर तक लाने वाले मोटरसाइकिल के सशस्त्र सवार होने के आरोपी गणेश मिस्किन (26) की सीडीआर विश्लेषण रिपोर्ट के अनुसार, उसका फोन, जो हुबली में था, के पास रात 6 सितंबर, 2017 को 1.24 बजे तक कोई इनकमिंग या आउटगोइंग कॉल नहीं थी। एसआईटी ने यह भी पाया कि हत्या को अंजाम देने के लिए मिस्किन 4 सितंबर और 5 सितंबर, 2017 को बेंगलुरु में था, जो 5 सितंबर को रात 8 बजे हुआ और वह बेंगलुरु से लगभग 350 किलोमीटर दूर हुबली लौटने के लिए बस में सवार हुआ।
सुरेश की छह साल की बेटी का सरकारी स्कूल में उपस्थिति रजिस्टर भी इस बात के प्रमाण के रूप में प्रस्तुत किया गया है कि उसने अपने परिवार को कुनिगल शहर में अपने घर भेजा था ताकि कथित हत्यारे उसके घर का इस्तेमाल कर सकें। स्कूल ने यह कहते हुए एक रिपोर्ट प्रदान की है कि सुरेश की बेटी 4 सितंबर से 9 सितंबर, 2017 तक अनुपस्थित थी, साथ ही 7 से 12 अगस्त और 17 से 20 जून, 2017 तक, जब हत्या की कुछ तैयारी कथित रूप से हुई थी।
एसआईटी ने चार्जशीट के बारे में एक आधिकारिक बयान में कहा “अब तक की जांच से पता चला है कि सभी 18 आरोपी एक संगठित अपराध सिंडिकेट के सक्रिय सदस्य हैं। यह सिंडिकेट वर्ष 2010-11 में डॉ वीरेंद्र तावड़े उर्फ बडे भाईसाहब के नेतृत्व में बनाया गया था। सनातन प्रभात के एक पूर्व संपादक ने इस सिंडिकेट को वित्तीय सहायता प्रदान की”।